Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms