Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSC2Q02487 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC2Q02487 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms