Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DHODHQ02127 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DHODHQ02127 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms