Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAP1Q01518 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAP1Q01518 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms