Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms