Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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