Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms