Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms