Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA9P57773 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms