Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms