Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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