Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLK1P49759 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms