Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT6CP48668 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT6CP48668 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT6CP48668 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT6CP48668 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms