Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCR1P46094 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
XCR1P46094 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCR1P46094 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCR1P46094 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms