Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB4P28070 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms