Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLNP26678 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLNP26678 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms