Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms