Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HRCP23327 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HRCP23327 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HRCP23327 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HRCP23327 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HRCP23327 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HRCP23327 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HRCP23327 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HRCP23327 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HRCP23327 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HRCP23327 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HRCP23327 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms