Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms