Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms