Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms