Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEFMP07197 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFMP07197 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms