Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-HP01893 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms