Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX7O95931 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms