Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTL6BO94805 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTL6BO94805 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms