Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TUBB3-210ENST00000555810 767 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF664-205ENST00000539257 271 ntTSL 515.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GPAT4-203ENST00000519853 768 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DROSHA-218ENST00000512302 585 ntTSL 415.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB48-203ENST00000435905 1001 ntTSL 515.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HAUS7-203ENST00000435662 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 VRK3-206ENST00000594090 1448 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 415.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RTN4R-204ENST00000463936 458 ntTSL 415.83■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PKNOX1-210ENST00000607049 762 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ANXA6-204ENST00000517677 795 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLD1-207ENST00000596425 563 ntTSL 315.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NACC2-203ENST00000467669 452 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABCB8-207ENST00000469410 523 ntTSL 415.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MTA1-205ENST00000426567 568 ntTSL 315.77■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC004890.2-206ENST00000480864 1220 ntTSL 215.77■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ANXA6-208ENST00000519644 728 ntTSL 515.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABI2-207ENST00000413635 515 ntTSL 415.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERGEF-209ENST00000528369 559 ntTSL 315.74■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 E2F4-205ENST00000565226 446 ntTSL 515.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DAB2IP-206ENST00000436835 928 ntTSL 315.68■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACADM-216ENST00000534146 654 ntTSL 415.67■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACAD8-215ENST00000533387 3197 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CERCAM-204ENST00000420034 551 ntTSL 415.66■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SH3TC1-221ENST00000512100 755 ntTSL 315.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDR2-204ENST00000564542 1056 ntTSL 515.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TARS2-212ENST00000480070 832 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAHD2B-205ENST00000474849 508 ntTSL 515.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HUWE1-211ENST00000480438 564 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 VRK3-212ENST00000596814 1736 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPAS1-203ENST00000460015 558 ntTSL 415.59■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAHD2B-203ENST00000463096 1105 ntTSL 515.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AACS-204ENST00000418937 1235 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SFXN5-215ENST00000482542 546 ntTSL 415.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBM22-206ENST00000521464 731 ntTSL 415.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLK3-207ENST00000493100 873 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TPP1-213ENST00000531754 610 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MYO1C-219ENST00000575335 753 ntTSL 515.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLIN3-203ENST00000587462 604 ntTSL 415.52■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DDR1-260ENST00000507533 545 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPP2R3B-204ENST00000468169 713 ntTSL 315.47■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RCC1L-203ENST00000615250 592 ntTSL 415.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MMP25-AS1-201ENST00000570949 491 ntTSL 315.44■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF664-213ENST00000543017 455 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ANP32A-209ENST00000495764 504 ntTSL 515.4■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC84-208ENST00000534656 588 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 515.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MPP7-204ENST00000441595 1210 ntTSL 515.35■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FANCG-203ENST00000448890 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CENPT-203ENST00000561593 673 ntTSL 415.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1360.8 ms