Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX3O75364 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms