Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45BO75293 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms