Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AGRNO00468 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AGRNO00468 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AGRNO00468 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms