Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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