Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms