Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms