Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMC3Q9Y6N6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMC3Q9Y6N6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms