Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMED7Q9Y3B3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMED7Q9Y3B3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms