Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms