Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms