Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms