Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms