Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms