Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms