Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN4Q9UJW0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms