Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms