Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms