Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS1Q9NYS0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms