Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R2Q9NY27 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms