Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3GLB2Q9NR46 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3GLB2Q9NR46 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GLB2Q9NR46 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms