Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms