Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG5Q9H1Y0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms