Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HOXD1Q9GZZ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HOXD1Q9GZZ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HOXD1Q9GZZ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HOXD1Q9GZZ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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