Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF4Q9BUZ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms